Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms