Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms