Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms