Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msi2Q920Q6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msi2Q920Q6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msi2Q920Q6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msi2Q920Q6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msi2Q920Q6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msi2Q920Q6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Msi2Q920Q6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Msi2Q920Q6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Msi2Q920Q6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msi2Q920Q6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msi2Q920Q6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms