Protein–RNA interactions for Protein: Q920B9

Supt16h, FACT complex subunit SPT16, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt16hQ920B9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Supt16hQ920B9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Supt16hQ920B9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Supt16hQ920B9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Supt16hQ920B9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Supt16hQ920B9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Supt16hQ920B9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Supt16hQ920B9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Supt16hQ920B9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Supt16hQ920B9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Supt16hQ920B9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Supt16hQ920B9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Supt16hQ920B9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Supt16hQ920B9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Supt16hQ920B9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Supt16hQ920B9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Supt16hQ920B9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Supt16hQ920B9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Supt16hQ920B9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Supt16hQ920B9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Supt16hQ920B9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Supt16hQ920B9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Supt16hQ920B9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Supt16hQ920B9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Supt16hQ920B9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Supt16hQ920B9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt16hQ920B9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms