Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SncbQ91ZZ3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SncbQ91ZZ3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms