Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms