Protein–RNA interactions for Protein: Q91WB7

Ubtd1, Ubiquitin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubtd1Q91WB7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubtd1Q91WB7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms