Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms