Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NifkQ91VE6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NifkQ91VE6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms