Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cabp4Q8VHC5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms