Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms