Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cul7Q8VE73 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cul7Q8VE73 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cul7Q8VE73 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cul7Q8VE73 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cul7Q8VE73 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cul7Q8VE73 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cul7Q8VE73 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cul7Q8VE73 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cul7Q8VE73 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cul7Q8VE73 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cul7Q8VE73 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cul7Q8VE73 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cul7Q8VE73 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cul7Q8VE73 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cul7Q8VE73 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cul7Q8VE73 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cul7Q8VE73 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Cul7Q8VE73 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cul7Q8VE73 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cul7Q8VE73 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cul7Q8VE73 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cul7Q8VE73 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cul7Q8VE73 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cul7Q8VE73 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cul7Q8VE73 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cul7Q8VE73 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cul7Q8VE73 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cul7Q8VE73 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cul7Q8VE73 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cul7Q8VE73 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Cul7Q8VE73 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cul7Q8VE73 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cul7Q8VE73 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms