Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TgdsQ8VDR7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TgdsQ8VDR7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms