Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt25Q8VCW2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt25Q8VCW2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt25Q8VCW2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms