Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms