Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top1mtQ8R4U6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top1mtQ8R4U6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Top1mtQ8R4U6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top1mtQ8R4U6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top1mtQ8R4U6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Top1mtQ8R4U6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top1mtQ8R4U6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top1mtQ8R4U6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top1mtQ8R4U6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top1mtQ8R4U6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top1mtQ8R4U6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top1mtQ8R4U6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Top1mtQ8R4U6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Top1mtQ8R4U6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Top1mtQ8R4U6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Top1mtQ8R4U6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Top1mtQ8R4U6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Top1mtQ8R4U6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Top1mtQ8R4U6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Top1mtQ8R4U6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms