Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms