Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K9

E2f4, Transcription factor E2F4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f4Q8R0K9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
E2f4Q8R0K9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
E2f4Q8R0K9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
E2f4Q8R0K9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
E2f4Q8R0K9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
E2f4Q8R0K9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f4Q8R0K9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f4Q8R0K9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f4Q8R0K9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f4Q8R0K9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f4Q8R0K9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f4Q8R0K9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f4Q8R0K9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f4Q8R0K9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f4Q8R0K9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f4Q8R0K9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f4Q8R0K9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f4Q8R0K9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f4Q8R0K9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f4Q8R0K9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f4Q8R0K9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f4Q8R0K9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f4Q8R0K9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f4Q8R0K9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f4Q8R0K9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f4Q8R0K9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f4Q8R0K9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f4Q8R0K9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f4Q8R0K9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f4Q8R0K9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f4Q8R0K9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f4Q8R0K9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2f4Q8R0K9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms