Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Hecw1Q8K4P8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms