Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4M5

Commd1, COMM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd1Q8K4M5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Commd1Q8K4M5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd1Q8K4M5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Commd1Q8K4M5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Commd1Q8K4M5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Commd1Q8K4M5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Commd1Q8K4M5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd1Q8K4M5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Commd1Q8K4M5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd1Q8K4M5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Commd1Q8K4M5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd1Q8K4M5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd1Q8K4M5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Commd1Q8K4M5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Commd1Q8K4M5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd1Q8K4M5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd1Q8K4M5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Commd1Q8K4M5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd1Q8K4M5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd1Q8K4M5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd1Q8K4M5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd1Q8K4M5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd1Q8K4M5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd1Q8K4M5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd1Q8K4M5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd1Q8K4M5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd1Q8K4M5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd1Q8K4M5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd1Q8K4M5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd1Q8K4M5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd1Q8K4M5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd1Q8K4M5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd1Q8K4M5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd1Q8K4M5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd1Q8K4M5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd1Q8K4M5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd1Q8K4M5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd1Q8K4M5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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