Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh16f2Q8K3M1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms