Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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