Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W3

Txndc11, Thioredoxin domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc11Q8K2W3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Txndc11Q8K2W3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Txndc11Q8K2W3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Txndc11Q8K2W3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Txndc11Q8K2W3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Txndc11Q8K2W3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Txndc11Q8K2W3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Txndc11Q8K2W3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Txndc11Q8K2W3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Txndc11Q8K2W3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Txndc11Q8K2W3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Txndc11Q8K2W3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Txndc11Q8K2W3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Txndc11Q8K2W3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Txndc11Q8K2W3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Txndc11Q8K2W3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Txndc11Q8K2W3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Txndc11Q8K2W3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Txndc11Q8K2W3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Txndc11Q8K2W3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Txndc11Q8K2W3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Txndc11Q8K2W3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms