Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms