Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc12Q8K2L8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms