Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scara5Q8K299 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scara5Q8K299 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scara5Q8K299 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scara5Q8K299 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms