Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms