Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms