Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0Y2

Krt33a, Keratin, type I cuticular Ha3-I, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33aQ8K0Y2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms