Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms