Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trip10Q8CJ53 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trip10Q8CJ53 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trip10Q8CJ53 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trip10Q8CJ53 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trip10Q8CJ53 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trip10Q8CJ53 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trip10Q8CJ53 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trip10Q8CJ53 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trip10Q8CJ53 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trip10Q8CJ53 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trip10Q8CJ53 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trip10Q8CJ53 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trip10Q8CJ53 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trip10Q8CJ53 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trip10Q8CJ53 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trip10Q8CJ53 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trip10Q8CJ53 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trip10Q8CJ53 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trip10Q8CJ53 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trip10Q8CJ53 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trip10Q8CJ53 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trip10Q8CJ53 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trip10Q8CJ53 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trip10Q8CJ53 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Trip10Q8CJ53 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trip10Q8CJ53 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trip10Q8CJ53 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trip10Q8CJ53 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trip10Q8CJ53 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trip10Q8CJ53 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trip10Q8CJ53 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trip10Q8CJ53 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trip10Q8CJ53 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trip10Q8CJ53 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms