Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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