Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF7

Tcerg1, Transcription elongation regulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1Q8CGF7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcerg1Q8CGF7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcerg1Q8CGF7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcerg1Q8CGF7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcerg1Q8CGF7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tcerg1Q8CGF7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tcerg1Q8CGF7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tcerg1Q8CGF7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tcerg1Q8CGF7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tcerg1Q8CGF7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tcerg1Q8CGF7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcerg1Q8CGF7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tcerg1Q8CGF7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tcerg1Q8CGF7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tcerg1Q8CGF7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tcerg1Q8CGF7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tcerg1Q8CGF7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcerg1Q8CGF7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcerg1Q8CGF7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcerg1Q8CGF7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
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