Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbm28Q8CGC6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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