Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms