Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms