Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms