Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms