Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc90bQ8C3X2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms