Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Snx16Q8C080 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
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Snx16Q8C080 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Snx16Q8C080 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Snx16Q8C080 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Snx16Q8C080 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Snx16Q8C080 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Snx16Q8C080 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
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Snx16Q8C080 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx16Q8C080 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx16Q8C080 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx16Q8C080 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx16Q8C080 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx16Q8C080 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx16Q8C080 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx16Q8C080 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx16Q8C080 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx16Q8C080 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx16Q8C080 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx16Q8C080 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx16Q8C080 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx16Q8C080 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx16Q8C080 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx16Q8C080 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx16Q8C080 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx16Q8C080 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx16Q8C080 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx16Q8C080 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx16Q8C080 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx16Q8C080 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx16Q8C080 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx16Q8C080 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx16Q8C080 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx16Q8C080 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx16Q8C080 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms