Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 414.3 ms