Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ3

Lrtm1, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm1Q8BXQ3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Lrtm1Q8BXQ3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Lrtm1Q8BXQ3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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