Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slx1bQ8BX32 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slx1bQ8BX32 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slx1bQ8BX32 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slx1bQ8BX32 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slx1bQ8BX32 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slx1bQ8BX32 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slx1bQ8BX32 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slx1bQ8BX32 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slx1bQ8BX32 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slx1bQ8BX32 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slx1bQ8BX32 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slx1bQ8BX32 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slx1bQ8BX32 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slx1bQ8BX32 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slx1bQ8BX32 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slx1bQ8BX32 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slx1bQ8BX32 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slx1bQ8BX32 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slx1bQ8BX32 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slx1bQ8BX32 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slx1bQ8BX32 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms