Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube3dQ8BX13 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms