Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms