Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmod1Q8BVA4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms