Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gga3Q8BMI3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gga3Q8BMI3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gga3Q8BMI3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gga3Q8BMI3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gga3Q8BMI3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gga3Q8BMI3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gga3Q8BMI3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gga3Q8BMI3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gga3Q8BMI3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gga3Q8BMI3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gga3Q8BMI3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gga3Q8BMI3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gga3Q8BMI3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gga3Q8BMI3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gga3Q8BMI3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gga3Q8BMI3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gga3Q8BMI3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gga3Q8BMI3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gga3Q8BMI3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gga3Q8BMI3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gga3Q8BMI3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms