Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hirip3Q8BLH7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hirip3Q8BLH7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hirip3Q8BLH7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hirip3Q8BLH7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hirip3Q8BLH7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hirip3Q8BLH7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hirip3Q8BLH7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hirip3Q8BLH7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hirip3Q8BLH7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hirip3Q8BLH7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Hirip3Q8BLH7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms