Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV0

Spock3, Testican-3, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock3Q8BKV0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spock3Q8BKV0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms